Цистоскопията под анестезия може да диагностицира интерстициален цистит. Първоначално външният вид и капацитетът на пикочния мехур са нормални, но след напълване, изпразване и повторно напълване често се наблюдават разпръснати субмукозни кръвоизливи. Биопсията разкрива патологични промени в субепидермалния слой, включително оток, конгестия, телеангиектазия и периваскуларен интерстициален кръвоизлив. Може също така да помогне за изключване на някои карциноми in situ и туберкулозни лезии. При локализиран вулвит, малки еритематозни лезии присъстват в страничния вестибюл на химена, докато останалите лезии са нормални.
Острият цистит също се проявява със симптоми на дразнене на пикочния мехур като често уриниране, неотложни позиви и дизурия. Въпреки това терминалната хематурия е честа и урината съдържа голям брой бели кръвни клетки; посявката на урина ще разкрие бактерии. Жлезистият цистит също се проявява със симптоми на дразнене на пикочния мехур като често уриниране, неотложни позиви и дизурия. Ултразвуковото изследване обаче може да разкрие удебеляване на стената на пикочния мехур или-заемащи пространство лезии в пикочния мехур. Цистоскопията разкрива папиларни структури, а не повърхностни язви, а биопсията може да потвърди диагнозата. Туберкулозата на пикочния мехур може също да се прояви като истински язви, често засягащи областта около отвора на уретера от страната на туберкулозния бъбрек. Може да се появи пиурия и в урината да се открият туберкулозни бацили. Образното изследване на пикочните пътища може да покаже типични промени, характерни за бъбречна туберкулоза. Язвите на пикочния мехур, причинени от паразитни заболявания, приличат на интерстициален цистит и обикновено са по-чести при мъжете. Диагнозата може да се постави въз основа на наличието на паразитни яйца в урината или типични патологични характеристики на пикочния мехур. Неспецифичният цистит рядко се проявява с язви на пикочния мехур; гнойни клетки и инфекциозни бактерии често се откриват в урината и антибиотичното лечение е ефективно.
